La diversité des milieux naturels, la présence de grands secteurs où les dérangements sont relativement limités permettent à une faune variée et abondante de prospérer.
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La super-colonie des Chalet-à-Roch n’est probablement pas la plus grande super-colonie de fourmis des bois au monde, mais c’est la plus grande connue en Europe et la mieux étudiée.
Découverte en automne 1973, elle n’a cessé d’être l’objet de très nombreuses recherches depuis cette date.
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Le chamois
se rencontre en de nombreux endroits du Parc.
Fréquent en été, le chevreuil
gagne les régions basses durant l’hiver. Quant au cerf, il ne fait encore que des apparitions occasionnelles. Difficile à voir, le sanglier laisse des traces bien visibles dans les pâturages qu'il laboure à la recherche de vers et de bulbes. Ecureuil, lièvre, renard, blaireau, martre et hermine sont présents dans le Parc. Il existe aussi quelques colonies de marmottes. Enfin, le plus discret de tous, le lynx.
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